Katedra zoológie a antropológie

Laboratóriá

Multifunkčné laboratórium embryotechnologií

Naše laboratórium embryotechnológii je vybavené nasledujúcimi prístrojmi:

1. Inteligentný svetelný mikroskop s možnosťou imunofluorescencie Leica DM 4000 B
2. CCD kamera Leica DFC 480 s počítačom procesor pentium 2GHz
3. Ultramikrotóm SUPER NOVA Reichter-Jung
4. Horúcovzdušný sterilizátor Binder BD (+ 5 °C až + 110°C)
5. Vibračná platňa Heidolph VIBRA MAX 110 (frekvencia trepania (150-2500 ot/min)
6. Knife maker 7800 LKB
7. Hlbokomraziaci box Hettich (- 80°C)
8. Vyhrievacia platňa Labotech DHP 30 (max. 400 °C)
9. Odsávací box EKOSTAR FLOW HF BH
10. Chladnička s mrazničkou Zanussi ZK 21/11 ATO
11. UV lampa pre účely autorádiografie

Tieto prístroje umožňujú realizovať nasledovné metodiky:

• príprava biologických vzoriek (embryí, oocytov, tkanív) pre TEM (transmisnú elektrónovú mikroskopiu)
• zhotovovanie ultratenkých a polotenkých rezov pre účely štúdia ultraštruktúry sledovaných biologických vzoriek
• imuno-fluoresčencné analýzy biologických vzoriek s možnosťou nastavenia rôznych filtrov
• transfer obrazu sledovaného objektu s mikroskopu do PC za pomoci CCD kamery s možnosťou rôznych úprav, značenie a následné vyhodnocovanie sledovaných objektov
• uchovávanie vzoriek pri ultranízkych teplotách -80°C, čím sa mnohonásobne predĺži ich exspirácia
• možnosť polymerizácie vzoriek pri ultranízkych teplotách pre imunoelektrónovú mikroskopiu

Dobudovanie laboratória bolo zrealizované ako súčasť 2 rozvojových projektov MŠ:

• Rozvojový projekt MŠ SR: 532 - Dobudovanie multifunkčného biologického laboratória
• Rozvojový projekt MŠ SR: 533 - Multifunkčné laboratórium embryotechnológií

Ultramikrotóm + horúcovzdušný sterilizátor

Digestor

Inteligentný svetelný a florescenčný mikroskop Leica DM 4000 s CCD kamerou + PC

Pracovný stôl: knife maker, stereomikroskop, vibračná platňa

Hlboko mraziaci box

Fyziologicko-analytické laborátorium pre prácu s biologickými matricami

Špecializované analytické laboratórium pre kvapalinovú chromatografiu a hmotnostnú spektrometriu, fyziometriu a prácu s biologickými vzorkami. Laboratórium slúži pre kvalitatívne a kvantitatívne analýzy látok rôznej chemickej povahy (napr. s environmentálnym dopadom) v biologických matriciach (napr. moč, krv, tkanivo...). Laboratórium vzniklo za podpory projektu v rámci operačného programu ASFEU OPVaV- Environmentálne aspekty urbanizovaného prostredia- aktivita 2.1 Skríning vybraných antropometrických a fyziologických parametrov ovplyvnených ftalátmi.

Fyziologicko-analytické laborátorium

Certifikát

Vedecké zameranie laboratória

Analýza environmentálnych endokrinných disruptorov v biologických matriciach, skríning fyziologických a somatometrických parametrov, so zohľadnením veku, pohlavia a ďalších aspektov. Laboratórium umožňuje analyzovať funkcie vybraných epigenetických faktorov (enzýmy, transkripčné faktory atď.) na embryogenézu cicavcov na proteomickej úrovni a základné reprodukčné a morfologické parametre živočíchov; taktiež kvalitatívnu a kvantitatívnu LC-MS a LC-MS/MS analýzu proteínových markerov počas embryogenézy vybraných druhov cicavcov v záťažových environmentálnych podmienkach.

Projekty

Laboratórium je súčasťou výskumného centra „AgroBioTech“, vybudovaného v partnerstve UKF v Nitre s SPU v Nitre a ÚGBR SAV v Nitre. Vzniklo za podpory projektu v rámci operačného programu ASFEU OPVaV- Environmentálne aspekty urbanizovaného prostredia- aktivita 2.1 Skríning vybraných antropometrických a fyziologických parametrov ovplyvnených ftalátmi, v rámci projektov Štrukturálnych fondov EÚ. Vybudovanie a činnosť laboratória boli, resp. sú podporené troma národnými projektmi (APVV, VEGA) a dvomi projektmi Štrukturálnych fondov EÚ.

Prístroje

Vysokoúčinný kvapalinový chromatograf (HPLC-1120 Infinity, Agilent) s hmotnostným spektrometrom -trojitý quadrupól (MS/MS) (6410B, Agilent)-plne automatizovaná zostava kvapalinového chromatografu pozostávajúca z in-line degaseru, binárnej pumpy (600bar), automatického dávkovača a DAD (skenovanie pri vlnových dĺžkach 190-640 nm). Systém má možnosť kontroly teploty vzoriek ako aj mobilnej fázy. Hmotnostný spektrometer je vybavený ESI ako aj APCI ionizačným zdrojom a trojitým kvadrupólovým detektorom, vhodným pre kvantitatívne stanovenie známych látok s využitím najmä v toxikologických, environmentálnych analýzach a vo farmaceutickom priemysle. Rozsah meraných hmôt (m/z) je 5-2250 amu, rýchlosť skenovania 12 500 amu/s s presnosťou m/z na 0,1 amu.

Nano HPLC s ChipCube a hmotnostný spektrofotometer Q-TOF (Agilent 6500 Series)- vysokorozlišovací hmotnostný spektrometer s presným určením hmoty typu QTOF pre prácu s čipovou nano-HPLC s rozlíšením min. 40 000, citlivosťoou takou, aby bolo možné identifikovať min. 2 peptidy z 200 attomolov BSA peptidového digestu, softvér na štúdium metabolomiky s databázou MS/MS spektier min 2000 metabolitov a profilovacieho softvéru na hľadanie štatisticky významných odlišností veľkých skupín vzoriek vrátane principal componenet analysis metódy.

SPE automat GX-274 ASPEC- plne automatizovaný systém s pojazdnými ramenami, ktorý je kompletným riešením pre SPE: proces predúpravy vzorky. SPE automat 4x rýchlejšie vykonáva extrakciu tuhou fázou (solid phase extraction). Obsahuje štyri duálne injekčné pumpy vybavené nezávislými snímačmi tlaku pre každú pumpu monitorujúcimi tlak pri každom nástreku. Umožňuje použitie 1, 3 a 6 ml SPE kolóniek Eluovaný produkt môže byť frakcionovaný do rôznych zberných skúmaviek. SPE proces môže byť vykonaný buď v dávkovacom alebo sekvenčnom režime s cieľom optimalizovať priepustnosť a účinnosť.

SPE-Manifold s visidry attachment- zariadenie pre manuálnu extrakciu tuhou fázou (SPE-Solid phase extraction) umožňujúce predúpravu vzoriek pred vlastnou chromatografickou analýzou. Obsahuje 12 pozícií pre SPE kolónky s objemom 1-3 ml a s príslušenstvom (visidry attachment) na zakoncentrovanie vzoriek.

Vibračná platňa Heidolph VIBRAMAX 110- frekvencia trepania (150- 2500 ot/min. Typ trepačky je určený pre trepanie skúmaviek, fliaš a Erlenmeyerových baniek. Vybavený plynulým nastavením frekvencie vibračného kruhového pohybu s integrovaným časovačom 0...120 min alebo trvalým chodom.

Horúcovzdušný sterilizátor Binder BD- zariadenie s presným rozpätím teplôt (+5 °C až +110°C) umožňujúce sušenie a zahrievanie materiálu. Vybavené elektronickým PID-kontrolným systémom s digitálnym displejom.

Vyhrievacia platňa Labotech DHP 30-vyhrievacia platňa s digitálnym displejom umožňujúca postupné vyhrievanie max. do 400 °C, vybavená externým teplotným senzorom.

Trepačka- vortex Reax control Heidolph- univerzálna trepačka typu „vortex“ určená pre trepanie jednotlivých skúmaviek alebo mikroskúmaviek typu „Eppendorf“. Výborné výsledky miešania sú zabezpečené kruhovitým a vibračným pohybom s plynule nastaviteľnou frekvenciou a elektronickou reguláciou otáčok. Prepínač umožňuje nepretržitý chod alebo automatické spúšťanie pri opretí skúmavky o mostík. Rozsah otáčok 0-2500 /min.

pH-meter Phenomenal 1000L VWR collection-laboratórny pH meter súčasne zobrazenie hodnoty pH, mV a teploty (okrem zobrazenia možno dátum, čas, atď ukázať) trojpolohový s LED podsvietením. Automatická a manuálna kalibrácia (1 až 3 body) . Automatické rozpoznanie pufrov DIN a NIST pufrov (1,68 / 4,00 / 6,86 / 9,18 / 12,54). Tri ďalšie technické pufre (4,00 / 7,00 / 10,00), v pamäti . Pokročilý auto-test a diagnostika. Rozlíšenie voliteľné 0,1/0,01/0,001pH, rozsah -2,000 až +19,999 pH a presnosť ±0,005 pH ±1 digit.

SPE-Manifold s visidry attachment- zariadenie pre manuálnu extrakciu tuhou fázou (SPE-Solid phase extraction) umožňujúce predúpravu vzoriek pred vlastnou chromatografickou analýzou. Obsahuje 12 pozícií pre SPE kolónky s objemom 1-3 ml a s príslušenstvom (visidry attachment) na zakoncentrovanie vzoriek.

Digitálne váhy KERN 510- laboratórne váhy s LCD displejom umožňujúce váženie s presnosťou 0,001g a overovacou hmotnosťou 0,01g (rozsah min 0,02g max 300g)

Ponuka analýz pre komerčnú i nekomerčnú prax

Okrem výskumnej činnosti na projektoch je možné prístroje fyziologicko-analytického laboratória využiť aj pre odbornú verejnosť.

Vedúca laboratória: doc. Ing. Ida Petrovičová, PhD.
Ostatní pracovníci laboratória: RNDr. Martin Morovič, PhD., RNDr. Branislav Kolena, PhD.; Mgr. Tomáš Pilka, PhD.; prof. RNDr. Mária Vondráková, CSc.; RNDr. Barbora Matejovičová, PhD.; Mgr. Miroslav Perniš, PhD.; Michaela Földešiová
Kontaktná adresa laboratória: Katedra zoológie a antropológie FPV UKF v Nitre, Nábrežie mládeže 91, 949 74 Nitra, tel. 037 6408 716, e-mail: ipetrovicova@ukf.sk